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電泳基礎(chǔ)知識(shí)及電泳分析常用方法

[ 2009-8-17 ]  [轉(zhuǎn)載請(qǐng)注明來(lái)源:就是要儀器網(wǎng) www.bedgirls.com]

電泳基礎(chǔ)知識(shí)及電泳分析常用方法

電泳是指荷電的膠體顆粒在電場(chǎng)中的移動(dòng)。
     在離子移動(dòng)的物理化學(xué)理論中,按照Debye-Huckel的理論。電泳決定于環(huán)繞每個(gè)離子的離子霧中的擴(kuò)散雙電層。當(dāng)離子的尺寸越大、溶液的離子強(qiáng)度越高時(shí),這種電泳現(xiàn)象就變得越明顯。所以電泳現(xiàn)象中的表面電勢(shì)和雙電層的因素起著決定性的作用。
早期研究發(fā)現(xiàn),許多生物膠體,如蛋白質(zhì)、酶等有特征的電泳遷移率。此遷移率在很大程度上取決于溶液的pH。因此利用這種電泳特征作為對(duì)物質(zhì)的鑒定引起人們廣泛的興趣。特別在那個(gè)時(shí)候,關(guān)于蛋白質(zhì)和酶的化學(xué)本質(zhì)和物理性質(zhì)還知道得不多。
    以后,電泳不僅作為一種現(xiàn)象,而且作為一種技術(shù)方法得到不斷發(fā)展。從界面分離到各種區(qū)帶電泳,開(kāi)辟了混合物的電泳分析的可能性。由于電泳性質(zhì)的高度特異性,甚至用結(jié)晶純化的樣品也可在電泳分析中分出兩個(gè)或更多的電泳帶。又由于電泳方法的溫和性,對(duì)不穩(wěn)定的生物大分子的分離純化有時(shí)比其他分離技術(shù)如沉淀、離心、層析等更為方便、可靠,甚至可作為具有一定規(guī)模的制備方法。

分析方法:

一)醋酸纖維素薄膜電泳

     醋酸纖維素是提纖維素的羥基乙;纬傻睦w維素醋酸酯。由該物質(zhì)制成的薄膜稱為醋酸纖維素薄膜。這種薄膜對(duì)蛋白質(zhì)樣品吸附性小,幾乎能完全消除紙電泳中出現(xiàn)的“拖尾”現(xiàn)象,又因?yàn)槟さ挠H水性比較小,它所容納的緩沖液也少,電泳時(shí)電流的大部分由樣品傳導(dǎo),所以分離速度快,電泳時(shí)間短,樣品用量少,5靏的蛋白質(zhì)可得到滿意的分離效果。因此特別適合于病理情況下微量異常蛋白的檢測(cè)。

醋酸纖維素膜經(jīng)過(guò)冰醋酸乙醇溶液或其它透明液處理后可使膜透明化有利于對(duì)電泳圖譜的光吸收掃描測(cè)定和膜的長(zhǎng)期保存。

⒈材料與試劑醋酸纖維素膜一般使用市售商品,常用的電泳緩沖液為pH8.6的巴比妥緩沖液,濃度在0.05-0.09mol/L。

⒉操作要點(diǎn)

       ⑴膜的預(yù)處理:必須于電泳前將膜片浸泡于緩沖液,浸透后,取出膜片并用濾紙吸去多余的緩沖液,不可吸得過(guò)干。

⑵加樣:樣品用量依樣品濃度、本身性質(zhì)、染色方法及檢測(cè)方法等因素決定。對(duì)血清蛋白質(zhì)的常規(guī)電泳分析,每cm加樣線不超過(guò)1靗,相當(dāng)于60-80靏的蛋白質(zhì)。

⑶電泳:可在室溫下進(jìn)行。電壓為25V/cm,電流為0.4-0.6mA/cm寬。

       ⑷染色:一般蛋白質(zhì)染色常使用氨基黑和麗春紅,糖蛋白用甲苯胺藍(lán)或過(guò)碘酸-Schiff試劑,脂蛋白則用蘇丹黑或品紅亞硫酸染色。

⑸脫色與透明:對(duì)水溶性染料最普遍應(yīng)用的脫色劑是5%醋酸水溶液。為了長(zhǎng)期保存或進(jìn)行光吸收掃描測(cè)定,可浸入冰醋酸:無(wú)水乙醇=30:70(V/V)的透明液中。

 

(二)凝膠電泳

     以淀粉膠、瓊脂或瓊脂糖凝膠、聚丙烯酰胺凝膠等作為支持介質(zhì)的區(qū)帶電泳法稱為凝膠電泳。其中聚丙烯酰胺凝膠電泳(polyacrylamide gel electrophoresis,PAGE)普遍用于分離蛋白質(zhì)及較小分子的核酸。瓊脂糖凝膠孔徑較大,對(duì)一般蛋白質(zhì)不起分子篩作用,但適用于分離同工酶及其亞型,大分子核酸等應(yīng)用較廣,介紹如下:

⒈瓊脂糖凝膠電泳的原理概述瓊脂糖是由瓊脂分離制備的鏈狀多糖。其結(jié)構(gòu)單元是D-半乳糖和3.6-脫水-L-半乳糖。許多瓊脂糖鏈依氫鍵及其它力的作用使其互相盤(pán)繞形成繩狀瓊脂糖束,構(gòu)成大網(wǎng)孔型凝膠。因此該凝膠適合于免疫復(fù)合物、核酸與核蛋白的分離、鑒定及純化。在臨床生化檢驗(yàn)中常用于LDH、CK等同工酶的檢測(cè)。

⒉瓊脂糖凝膠電泳分離核酸的基本技術(shù)在一定濃度的瓊脂糖凝膠介質(zhì)中,DNA分子的電泳遷移率與其分子量的常用對(duì)數(shù)成反比;分子構(gòu)型也對(duì)遷移率有影響,如共價(jià)閉環(huán)DNA>直線DNA>開(kāi)環(huán)雙鏈DNA。當(dāng)凝膠濃度太高時(shí),凝膠孔徑變小,環(huán)狀DNA(球形)不能進(jìn)入膠中,相對(duì)遷移率為0,而同等大小的直線DNA(剛性棒狀)可以按長(zhǎng)軸方向前移,相對(duì)遷移率大于0。

⑴設(shè)備與試劑:瓊脂糖凝膠電泳分為垂直及水平型兩種。其中水平型可制備低濃度瓊脂糖凝膠,而且制膠與加樣都比較方便,故應(yīng)用比較廣泛。核酸分離一般用連續(xù)緩沖體系,常用的有TBE(0.08mol/l Tris·HCl,pH8.5,0.08mol/L硼酸,0.0024mol/l EDTA)和THE(0.04mol/l Tris·HCl。pH7.8,0.2mol/L醋酸鈉,0.0018mol/l EDTA)。

          ⑵凝膠制備:用上述緩沖液配制0.5%-0.8%瓊脂糖凝膠溶液,沸水浴或微波爐加熱使之融化,冷至55℃時(shí)加入溴化乙錠(EB)至終濃度為0.5靏/ml,然后將其注入玻璃板或有機(jī)玻璃板組裝好的模子中,厚度依樣品濃度而定。注膠時(shí),梳齒下端距玻璃板0.5-1.0mm,待脫凝固后,取出梳子,加入適量電極緩沖液使板膠浸沒(méi)在緩沖液下1mm處。

⑶樣品制備與加樣:溶解于TBE或THE內(nèi)的樣品應(yīng)含指示染料(0.025%溴酚藍(lán)或桔黃橙)、蔗糖(10%-15%)或甘油(5%-10%),也可使用2.5%Fico Ⅱ增加比重,使樣品集中,每齒孔可加樣5-10靏。

          ⑷電泳:一般電壓為5-15V/cm。對(duì)大分子的分離可用電壓5V/cm。電泳過(guò)程最好在低溫條件下進(jìn)行。

          ⑸樣品回收:電泳結(jié)束后在紫外燈下觀察樣品的分離情況,對(duì)需要的DNA分子或特殊片段可從電泳后的凝膠中以不同的方法進(jìn)行回收,如電泳洗脫法:在紫外燈下切取含核酸區(qū)帶的凝膠,將其裝入透析袋(內(nèi)含適量新鮮電泳緩沖液),扎緊透析袋后,平放在水平型電泳槽兩電極之間的淺層緩沖液中,100V電泳2-3小時(shí),然后正負(fù)電極交換,反向電泳2分鐘,使透析袋上的DNA釋放出來(lái)。吸出含DNA的溶液,進(jìn)行酚抽提、乙醇沉淀等步驟即可完成樣品的回收。其它還有低融點(diǎn)瓊脂糖法、醋酸銨溶液浸出法、冷凍擠壓法等,但各種方法都僅僅有利于小分子量DNA片段(<1kb)的回收,隨著DNA分子量的增大,回收量顯著下降。

 

(三)等電聚焦電泳技術(shù)

      等電聚焦(isoelectric focusing,IEF)是60年代中期問(wèn)世的一種利用有pH梯度的介質(zhì)分離等電點(diǎn)不同的蛋白質(zhì)的電泳技術(shù)。由于其分辨率可達(dá)0.01pH單位,因此特別適合于分離分子量相近而等電點(diǎn)不同的蛋白質(zhì)組分。

⒈IEF的基本原理在IEF的電泳中,具有pH梯度的介質(zhì)其分布是從陽(yáng)極到陰極,pH值逐漸增大。如前所述,蛋白質(zhì)分子具有兩性解離及等電點(diǎn)的特征,這樣在堿性區(qū)域蛋白質(zhì)分子帶負(fù)電荷向陽(yáng)極移動(dòng),直至某一pH位點(diǎn)時(shí)失去電荷而停止移動(dòng),此處介質(zhì)的pH恰好等于聚焦蛋白質(zhì)分子的等電點(diǎn)(pl)。同理,位于酸性區(qū)域的蛋白質(zhì)分子帶正電荷向陰極移動(dòng),直到它們的等電點(diǎn)上聚焦為止?梢(jiàn)在該方法中,等電點(diǎn)是蛋白質(zhì)組分的特性量度,將等電點(diǎn)不同的蛋白質(zhì)混合物加入有pH梯度的凝膠介質(zhì)中,在電場(chǎng)內(nèi)經(jīng)過(guò)一定時(shí)間后,各組分將分別聚焦在各自等電點(diǎn)相應(yīng)的pH位置上,形成分離的蛋白質(zhì)區(qū)帶。

⒉pH梯度的組成pH梯度的組成方式有二種,一種是人工pH梯度,由于其不穩(wěn)定,重復(fù)性差,現(xiàn)已不再使用。另一種是天然pH梯度。天然pH梯度的建立是在水平板或電泳管正負(fù)極間引入等電點(diǎn)彼此接近的一系列兩性電解質(zhì)的混合物,在正極端吸入酸液,如硫酸、磷酸或醋酸等,在負(fù)極端引入堿液,如氫氧化鈉、氨水等。電泳開(kāi)始前兩性電解質(zhì)的混合物pH為一均值,即各段介質(zhì)中的pH相等,用pH0表示。電泳開(kāi)始后,混合物中pH最低的分子,帶負(fù)電荷最多,pI1為其等電點(diǎn),向正極移動(dòng)速度最快,當(dāng)移動(dòng)到正極附近的酸液界面時(shí),pH突然下降,甚至接近或稍低于PI1,這一分子不再向前移動(dòng)而停留在此區(qū)域內(nèi)。由于兩性電解質(zhì)具有一定的緩沖能力,使其周?chē)欢ǖ膮^(qū)域內(nèi)介質(zhì)的pH保持在它的等電點(diǎn)范圍。pH稍高的第二種兩性電解質(zhì),其等電點(diǎn)為pI2,也移向正極,由于pI2>pI1,因此定位于第一種兩性電解質(zhì)之后,這樣,經(jīng)過(guò)一定時(shí)間后,具有不同等電點(diǎn)的兩性電解質(zhì)按各自的等電點(diǎn)依次排列,形成了從正極到負(fù)極等電點(diǎn)遞增,由低到高的線性pH梯度。

⒊兩性電解質(zhì)載體與支持介質(zhì)理想的兩性電解質(zhì)載體應(yīng)在pI處有足夠的緩沖能力及電導(dǎo),前者保證pH梯度的穩(wěn)定,后者允許一定的電流通過(guò)。不同pI的兩性電解質(zhì)應(yīng)有相似的電導(dǎo)系數(shù)從而使整個(gè)體系的電導(dǎo)均勻。兩性電解質(zhì)的分子量要小,易于應(yīng)用分子篩或透析方法將其與被分離的高分子物質(zhì)分開(kāi),而且不應(yīng)與被分離物質(zhì)發(fā)生反應(yīng)或使之變性。

常用的pH梯度支持介質(zhì)有聚丙烯酰胺凝膠、瓊脂糖凝膠、葡聚糖凝膠等,其中聚丙烯酰胺凝膠為最常應(yīng)用。

電泳后,不可用染色劑直接染色,因?yàn)槌S玫牡鞍踪|(zhì)染色劑也能和兩性電解質(zhì)結(jié)合,因此應(yīng)先將凝膠浸泡在5%的三氯醋酸中去除兩性電解質(zhì),然后再以適當(dāng)?shù)姆椒ㄈ旧?

 

(四)其他電泳技術(shù)

⒈IEF/SDS-PAGE雙向電泳法1975年O′Farrall等人根據(jù)不同組份之間的等電點(diǎn)差異和分子量差異建立了IEF/Sd S-PAGE雙向電泳。其中IEF電泳(管柱狀)為第一向,SDS-PAGE為第二向(平板)。在進(jìn)行第一向IEF電泳時(shí),電泳體系中應(yīng)加入高濃度尿素、適量非離子型去污劑NP-40。蛋白質(zhì)樣品中除含有這兩種物質(zhì)外還應(yīng)有二硫蘇糖醇以促使蛋白質(zhì)變性和肽鏈?zhǔn)嬲埂?

IEF電泳結(jié)束后,將圓柱形凝膠在SDS-PAGE所應(yīng)用的樣品處理液(內(nèi)含SDS、-巰基乙醇)中振蕩平衡,然后包埋在SDS-PAGE的凝膠板上端,即可進(jìn)行第二向電泳。

IEF/ SDS-PAGE雙向電泳對(duì)蛋白質(zhì)(包括核糖體蛋白、組蛋白等)的分離是極為精細(xì)的,因此特別適合于分離細(xì)菌或細(xì)胞中復(fù)雜的蛋白質(zhì)組分。

⒉毛細(xì)管電泳 Neuhoff等人于1973年建立了毛細(xì)管均一濃度和梯度濃度凝膠用來(lái)分析微量蛋白質(zhì)的方法,即微柱膠電泳,均一濃度的凝膠是將毛細(xì)管浸入凝膠混合液中,使凝膠充滿總體積的2/3左右,然后將其撳入約厚2mm的代用粘土墊上,封閉管底,用一支直徑比盛凝膠的毛細(xì)管更細(xì)的硬質(zhì)玻璃毛細(xì)管吸水鋪在凝膠上。聚合后,除去水層并用毛細(xì)管加蛋白質(zhì)溶液(0.1-1.0靗,濃度為1-3mg/ml)于凝膠上,毛細(xì)管的空隙用電極緩沖液注滿,切除插入粘土部分,即可電泳。



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